1. Basic Information

Name:	MUC5A_HUMAN
Accession#:	P98088
Description:	Mucin-5AC
AA Number:	5030
Sequence:	1 51 101 151 201 251 301 351 401 451 501 551 601 651 701 751 801 851 901 951 1001 1051 1101 1151 1201 1251 1301 1351 1401 1451 1501 1551 1601 1651 1701 1751 1801 1851 1901 1951 2001 2051 2101 2151 2201 2251 2301 2351 2401 2451 2501 2551 2601 2651 2701 2751 2801 2851 2901 2951 3001 3051 3101 3151 3201 3251 3301 3351 3401 3451 3501 3551 3601 3651 3701 3751 3801 3851 3901 3951 4001 4051 4101 4151 4201 4251 4301 4351 4401 4451 4501 4551 4601 4651 4701 4751 4801 4851 4901 4951 5001    MSVGRRKLAL LWALALALAC TRHTGHAQDG SSESSYKHHP ALSPIARGPS GVPLRGATVF PSLRTIPVVR ASNPAHNGRV CSTWGSFHYK TFDGDVFRFP GLCNYVFSEH CGAAYEDFNI QLRRSQESAA PTLSRVLMKV DGVVIQLTKG SVLVNGHPVL LPFSQSGVLI QQSSSYTKVE ARLGLVLMWN HDDSLLLELD TKYANKTCGL CGDFNGMPVV SELLSHNTKL TPMEFGNLQK MDDPTEQCQD PVPEPPRNCS TGFGICEELL HGQLFSGCVA LVDVGSYLEA CRQDLCFCED TDLLSCVCHT LAEYSRQCTH AGGLPQDWRG PDFCPQKCPN NMQYHECRSP CADTCSNQEH SRACEDHCVA GCFCPEGTVL DDIGQTGCVP VSKCACVYNG AAYAPGATYS TDCTNCTCSG GRWSCQEVPC PDTCSVLGGA HFSTFDGKQY TVHGDCSYVL TKPCDSSAFT VLAELRRCGL TDSETCLKSV TLSLDGAQTV VVIKASGEVF LNQIYTQLPI SAANVTIFRP STFFIIAQTS LGLQLNLQPV PTMQLFMQLA PKLRGQTCGL CGNFNSIQAD DFRTLSGVVE ATAAAFFNTF KTQAACPNIR NSFEDPCSLS VENEKYAQHW CSQLTDADGP FGRCHAAVKP GTYYSNCVFD TCNCERSEDC LCAALSSYVH ACAAKGVQLG GWRDGVCTKP MTTCPKSMTY HYHVSTCQPT CRSLSEGDIT CSVGFIPVDG CICPKGTFLD DTGKCVQASN CPCYHRGSMI PNGESVHDSG AICTCTHGKL SCIGGQAPAP VCAAPMVFFD CRNATPGDTG AGCQKSCHTL DMTCYSPQCV PGCVCPDGLV ADGEGGCITA EDCPCVHNEA SYRAGQTIRV GCNTCTCDSR MWRCTDDPCL ATCAVYGDGH YLTFDGQSYS FNGDCEYTLV QNHCGGKDST QDSFRVVTEN VPCGTTGTTC SKAIKIFLGG FELKLSHGKV EVIGTDESQE VPYTIQQMGI YLVVDTDIGL VLLWDKKTSI FINLSPEFKG RVCGLCGNFD DIAVNDFATR SRSVVGDVLE FGNSWKLSPS CPDALAPKDP CTANPFRKSW AQKQCSILHG PTFAACHAHV EPARYYEACV NDACACDSGG DCECFCTAVA AYAQACHEVG LCVCLRTPSI CPLFCDYYNP EGQCEWHYQP CGVPCLRTCR NPRGDCLRDV RGLEGCYPKC PPEAPIFDED KMQCVATCPT PPLPPRCHVH GKSYRPGAVV PSDKNCQSCL CTERGVECTY KAEACVCTYN GQRFHPGDVI YHTTDGTGGC ISARCGANGT IERRVYPCSP TTPVPPTTFS FSTPPLVVSS THTPSNGPSS AHTGPPSSAW PTTAGTSPRT RLPTASASLP PVCGEKCLWS PWMDVSRPGR GTDSGDFDTL ENLRAHGYRV CESPRSVECR AEDAPGVPLR ALGQRVQCSP DVGLTCRNRE QASGLCYNYQ IRVQCCTPLP CSTSSSPAQT TPPTTSKTTE TRASGSSAPS STPGTVSLST ARTTPAPGTA TSVKKTFSTP SPPPVPATST SSMSTTAPGT SVVSSKPTPT EPSTSSCLQE LCTWTEWIDG SYPAPGINGG DFDTFQNLRD EGYTFCESPR SVQCRAESFP NTPLADLGQD VICSHTEGLI CLNKNQLPPI CYNYEIRIQC CETVNVCRDI TRLPKTVATT RPTPHPTGAQ TQTTFTTHMP SASTEQPTAT SRGGPTATSV TQGTHTTLVT RNCHPRCTWT KWFDVDFPSP GPHGGDKETY NNIIRSGEKI CRRPEEITRV QCRAKSHPEV SIEHLGQVVQ CSREEGLVCR NQDQQGPFKM CLNYEVRVLC CETPRGCHMT STPGSTSSSP AQTTPSTTSK TTEIQASGSS APSSTPGTVS LSTARTTPAP GTATSVKKTF STPSPPPVPA TSTSSMSTTA PGTSVVSSKP TPTEPSTSSC LQELCTWTEW IDGSYPAPGI NGGDFDTFQN LRDEGYTFCE SPRSVQCRAE SFPNTPLGRL GQDVICSHTE GLICLNKNQL PPICYNYEIR IQCCETVNVC RDITRPPKTV ATTRPTPHPT GAQTQTTFTT HMPSASTEQP TATSRGGPTA TSVTQGTHTT PVTRNCHPRC TWTTWFDVDF PSPGPHGGDK ETYNNIIRSG EKICRRPEEI TRLQCRAKSH PEVSIEHLGQ VVQCSREEGL VCRNQDQQGP FKMCLNIEVR VLCCETPKGC PVTSTPVTAP STPSGRAISP TQSTSSWQKS RTTTLVTTST TSTPQTSTTY AHTTSTTSAP TARTTSAPTT STTSVPTTST ISGPKTTPSP VPTTSTTSAA TTSTISAPTT STTSVPGTTP SPVLTTSTTS APTTRTTSAS PAGTTSGPGN TPSPVPTTST ISAPTTSITS APTTSTTSAP TSSTTSGPGT TPSPVPTTSI TSAPTTSTTS APTTSTTSAP TTSTTSAPTT STTSAPTTST TSTPTSSTTS TPQTSTTSAS TTSITSGPGT TPSPVPTTST TSAPTTSTTS AATTSTISAP TTSTTSAPTT STTSASTASK TSGLGTTPSP IPTTSTTSPP TTSTTSASTA SKTSGPGTTP SPVPTTSTIF APRTSTTSAS TTSTTPGPGT TPSPVPTTST ASVSKTSTSH VSISKTTHSQ PVTRDCHLRC TWTKWFDVDF PSPGPHGGDK ETYNNIIRSG EKICRRPEEI TRLQCRAESH PEVSIEHLGQ VVQCSREEGL VCRNQDQQGP FKMCLNYEVR VLCCETPKGC PVTSTPVTAP STPSGRATSP TQSTSSWQKS RTTTLVTTST TSTPQTSTTS APTTSTTSAP TTSTTSAPTT STTSTPQTSI SSAPTSSTTS APTSSTISAR TTSIISAPTT STTSSPTTST TSATTTSTTS APTSSTTSTP QTSKTSAATS STTSSSGTTP SPVTTTSTAS VSKTSTSHVS VSKTTHSQPV TRDCHPRCTW TKWFDVDFPS PGPHGGDKET YNNIIRSGEK ICRRPQEITR LQCRAKSHPE VSIEHLGQVV QCSREEGLVC RNQDQQGPFK MCLNYEVRVL CCETPKGCPV TSTSVTAPSP LVGEPPAQTQ STSSWQKSRT TTLVTSSITS TTQTSTTSAP TTSTTPASIP STTSAPTTST TSAPTTSTTS APTTSTTSTP QTTTSSAPTS STTSAPTTST ISAPTTSTIS APTTSTTSAP TASTTSAPTS TSSAPTTNTT SAPTTSTTSA PITSTISAPT TSTTSTPQTS TISSPTTSTT PTPQTSTTSS PTTSTTSAPT TSTTSAPTTS TTSTPQTSIS SAPTSSTTSA PTASTISAPT TSTTSFHTTS TTSPPTSSTS STPQTSKTSA ATSSTTSGSG TTPSPVPTTS TASVSKTSTS HVSVSKTTHS QPVTRDCHPR CTWTKWFDVD FPSPGPHGGD KETYNNIIRS GEKICRRPEE ITRLQCRAES HPEVSIEHLG QVVQCSREEG LVCRNQDQQG PFKMCLNYEV RVLCCETPKG CPVTSTPVTA PSTPSGRATS PTQSTSSWQK SRTTTLVTTS TTSTPQTSTT SAPTTSTIPA STPSTTSAPT TSTTSAPTTS TTSAPTHRTT SGPTTSTTLA PTTSTTSAPT TSTNSAPTTS TISASTTSTI SAPTTSTISS PTSSTTSTPQ TSKTSAATSS TTSGSGTTPS PVPTTSTTSA STTSTTSAPT TSTTSGPGTT PSPVPSTSIT SAATTSTTSA PTTRTTSAPT SSMTSGPGTT PSPVPTTSTT SAPTTSTTSG PGTTPSPVPT TSTTSAPITS TTSGPGSTPS PVPTTSTTSA PTTSTTSAST ASTTSGPTTS TTSASTTSTI SPLTTSTTSA PITSMPSGPG TTPSPVPTTS TTSAPTTSTT SGPGTTPSPV PTTSTTSAPT TSTTSASTAS TTSGPGTTPS PVPTTSTTSA PTTSTTSAST ASTTSGPGTS LSPVPTTSTT SAPTTSTTSG PGTTPSPVPT TSTTSAPTTS TTSGPGTTPS PVPTTSTTPV SKTSTSHLSV SKTTHSQPVT SDCHPLCAWT KWFDVDFPSP GPHGGDKETY NNIIRSGEKI CRRPEEITRL QCRAESHPEV NIEHLGQVVQ CSREEGLVCR NQDQQGPFKM CLNYEVRVLC CETPRGCPVT SVTPYGTSPT NALYPSLSTS MVSASVASTS VASSSVASSS VAYSTQTCFC NVADRLYPAG STIYRHRDLA GHCYYALCSQ DCQVVRGVDS DCPSTTLPPA PATSPSISTS EPVTELGCPN AVPPRKKGET WATPNCSEAT CEGNNVISLS PRTCPRVEKP TCANGYPAVK VADQDGCCHH YQCQCVCSGW GDPHYITFDG TYYTFLDNCT YVLVQQIVPV YGHFRVLVDN YFCGAEDGLS CPRSIILEYH QDRVVLTRKP VHGVMTNEII FNNKVVSPGF RKNGIVVSRI GVKMYATIPE LGVQVMFSGL IFSVEVPFSK FANNTEGQCG TCTNDRKDEC RTPRGTVVAS CSEMSGLWNV SIPDQPACHR PHPTPTTVGP TTVGSTTVGP TTVGSTTVGP TTPPAPCLPS PICHLILSKV FEPCHTVIPP LLFYEGCVFD RCHMTDLDVV CSSLELYAAL CASHDICIDW RGRTGHMCPF TCPADKVYQP CGPSNPSYCY GNDSASLGAL REAGPITEGC FCPEGMTLFS TSAQVCVPTG CPRCLGPHGE PVKVGHTVGM DCQECTCEAA TWTLTCRPKL CPLPPACPLP GFVPVPAAPQ AGQCCPQYSC ACNTSRCPAP VGCPEGARAI PTYQEGACCP VQNCSWTVCS INGTLYQPGA VVSSSLCETC RCELPGGPPS DAFVVSCETQ ICNTHCPVGF EYQEQSGQCC GTCVQVACVT NTSKSPAHLF YPGETWSDAG NHCVTHQCEK HQDGLVVVTT KKACPPLSCS LDEARMSKDG CCRFCPLPPP PYQNQSTCAV YHRSLIIQQQ GCSSSEPVRL AYCRGNCGDS SSMYSLEGNT VEHRCQCCQE LRTSLRNVTL HCTDGSSRAF SYTEVEECGC MGRRCPAPGD TQHSEEAEPE PSQEAESGSW ERGVPVSPMH

*Highlighted peptides (with yellow background) have developed assays.
*Green background amino acids are PTMs.

2. Protein Separation

Sample Preparation: Cells from colon caner line HCT 116 were lysed in 8M urea/ 100mM ammonium bicarbonate buffer on ice. The equivalent of 60,000 cells were loaded onto a SDS gel. The protein of interest was excised and ingel digestion with trypsin was performed after reduction and alkylation with TCEP and IAA. 1/6 of the resulting digest was then analyzed on a Thermo Scientific TSQ mass spectrometer.

 

3. LC-MS/MS Data

NQDQQGPFK

    No LC-MS/MS for this peptide.

4. LC-MRM Screening

Peptides screening: Peptides and transitions for analysis were selected using a predictive peptide program. The results were screened for those with the highest specificity and the most intense transitions.